一、研究組
負責本館學術研究與交流計畫之擬訂及規劃、委託研究專案之資料蒐集及分析、館藏文物之相關研究、本館展示主題之撰擬、圖書資訊、出版品管理等事項。
二、典藏組
負責本館館藏文物典藏作業流程之擬訂、館藏文物之購藏、保存、管理、修復、維護及田野調查、典藏庫之設計、維護及管理等有關典藏事項。
三、展示組
負責本館各項展示主題計畫之擬訂、展示施作與展場之管理、監控、監督施工及驗收、展場燈光、電力及互動展示設施之維修、館際交流之規劃、研擬及執行等有關展示事項。
四、公共服務組
負責本館各類教育推廣活動、志工培訓;本館園區解說導覽設施內容之規劃設計、執行及導覽員之訓練;本館賣場等委外案件之辦理等有關公共服務事項。
五、行政室
負責本館議事、文書、檔案、印信、出納、事務管理、財產管理、研考、法制等事項,及其他支援服務事項。
六、會計及人事
本館置會計員及人事管理員,負責辦理會計及人事管理事項。
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