賴永祥為知名臺灣教會史與圖書館學之學者，同時也是長老教會長老。其生長背景、人際交往、學術歷程與個人關懷，不僅與長老教會有密切關連，更是臺灣近代社會發展史的重要縮影。國立臺灣歷史博物館重視賴長老於臺灣史的鑽研，尤其是涉外關係領域的學術傳承，將其著述重新整理、出版，讓世人共享研究成果，也向其致敬。賴永祥文集「歷史篇」第6冊以「明鄭及南明研究」為主題，收錄《明鄭研究叢輯》中9篇有關明鄭研究的譯著、簡述；刊於《臺灣文獻》的〈臺灣鄭氏與英國通商關係史〉；國科會補助研究成果〈鄭成功藩下鎮將簡表〉、〈明鄭藩下官爵表〉；以及《歷代寶案》中有關南明弘光以及隆武的文稿。內容從鄭成功入臺緣起「此地本為中國所有，應歸還原主」，強調延平復國大業的艱鉅，概述明鄭時期臺灣的規制、拓墾、設施，說明明鄭時期漢人在臺灣已有相當基礎；透過英國「商館記錄」（Factory Records）介紹鄭英通商協約的締結以及通商經過，為研究明鄭貿易史的必備資料；鎮將、官爵表則研究明鄭藩下授將軍號以及文武官僚的遞昇、存歿的概述簡歷，是最早有系統研究明鄭官爵的著作；《歷代寶案》則是琉球王朝歷代外交文書及其文稿集成，包括琉球與中國、朝鮮、臺灣以及一些東南亞國家來往情形，收有琉球與南明福王、唐王兩朝往來的文書。

著者：賴永祥 John Yung-hsiang Lai
（Lōa Éng-siông）
導讀：翁佳音、林偉盛

歷史篇Ⅱ/ 明鄭及南明研究

I：明鄭研究叢輯
1. 明鄭征菲企圖
2. 清荷征鄭始末
3. 鄭英通商略史
4. 明鄭時期英國商館記錄
5. 歷代寶案中之明鄭記載
6. 雜誌中有關明鄭論著目錄
7. 鄭成功光復臺灣紀略
8. 明鄭時期臺灣的開發梗概
9. 明鄭與天主教之關係
II：臺灣鄭氏與英國的通商關係史
III：明鄭藩下官爵表
IV：琉球歷代寶案之南明史料
V：Li-tai-pao-an（歷代寶案）, a Collection of Documents on
Foreign Relations of the Ryukyu Islands.
歷代寶案，琉球群島外交關係文件集（譯文）