本館設置之男女廁所便器數量共計29座，男、女比例為6：23，符合性別理念，並用心維護管理。自100年開館對外服務以來，經臺南市政府環境保護局歷次考核結果皆為「特優級」，103年更榮獲臺南市政府評核優良公廁觀光遊憩組第2名。
除基本設施及環境整潔列屬特優級外，提供的特殊性別貼心設施如下：
1.增設兒童安全座椅及換尿布臺，增進親子觀眾如廁便利、確保幼兒安全，提倡父母共同育兒觀念。
2.降低部分小便斗高度，以利兒童使用。
3.設置性別友善廁所，照顧第三性別觀眾之如廁權。
特優級廁所標章